UGENE — ОТКРЫТАЯ ПЛАТФОРМА БИОИНФОРМАТИКИ

Это интегрированный набор инструментов молекулярного биолога

Unipro UGENE  предоставляет множество методов обработки генетических и белковых последовательностей. Это — анализ, аннотирование, сравнение, поиск, выравнивание, моделирование, комплексные вычисления. Разнообразная визуализация, навигация и масштабирование, поддержка множества генетических форматов данных , оптимизация алгоритмов, возможности редактирования и графического построения различных  вычислительных схем существенно ускоряют работу. UGENE отлично работает на Windows, Mac OS, Linux и прост в установке и использовании. Обладает интерфейсом как на русском, так и на английском языке.

  • Редактирование и  аннотирование последовательностей
  • Поиск функциональных элементов и гомологов
  • Выравнивание и филогения
  • Клонирование in silico/ПЦР in silico
  • Работа с хроматограммами
  • Обработка данных NGS — сборка и визуализация генома, транскриптома, ChiP-Seq
  • Поиск геномных вариаций
  • Поиск в удаленных базах данных
  • Дизайнер вычислительных схем для многошагового анализа с десятками готовых схем

Полный список функционала можно посмотреть на сайте продукта.

UGENE распространяется под свободной лицензией GPL 2. Доступны багтрекер и исходный код продукта.

Поддержка пользователей идет по нескольким каналам — форум, email, видеоуроки, vKontakte, в Facebook.

Обучение пользователей проходит также в реальном времени на семинарах и вебинарах.

Мы предлагаем также:

  • Техническую поддержку в различных вариантах
  • Сборку специальных версий UGENE c новыми алгоритмами, базами данных, вычислительными конвейерами, интерфейсами, под другими лицензиями.
  • Адапатцию к облачным и графическим платформам,    вычислительным кластерам.
  • Разработку специализированного ПО для сопровождения исследовательских проектов.
ugene_logo1

SequenceView

MsaEditor

WorkflowDesigner