GeneCut — сервис для проектирования сборки генов и молекулярного клонирования
О продукте:
GeneCut — веб-сервис для проведения in silico экспериментов по сборке генов и молекулярному клонированию. Программа помогает подготовить последовательность гена к синтезу: выполнить обратную трансляцию, оптимизировать кодонный состав, удалить нежелательные сайты и мотивы, разбить последовательность на олигонуклеотиды или длинные блоки, а также смоделировать клонирование генетических конструкций. С дополнительной информацией вы можете ознакомиться в документации.
Подходит для:
- Сборки генов — Разбиение нуклеотидной последовательности на олигонуклеотиды для последующей сборки методами PCA и TBIO.
- Оптимизации последовательностей — Обратная трансляция аминокислотной последовательности и оптимизация кодонного состава под выбранный организм.
- Подготовки последовательностей к синтезу — Удаление сайтов рестрикции, сайтов сплайсинга и пользовательских мотивов из нуклеотидной последовательности.
- Молекулярного клонирования in silico — Моделирование клонирования одного или нескольких фрагментов в плазмиду методами Gibson assembly и Gateway.
- Работы с результатами расчетов — Просмотр отчетов, параметров запуска, результатов вычислений и скачивание полученных последовательностей.
Доступные версии и услуги:
- Веб-сервис GeneCut — Для самостоятельного проектирования сборки генов и клонирования через браузер.
- Интеграция с UGENE — Работа с расчетами GeneCut из UGENE: запуск, просмотр отчетов, получение входных и результирующих последовательностей.
- Разработка специализированных решений — Создание отдельных модулей или сервисов на базе GeneCut для задач синтетической биологии и молекулярного клонирования.
- Поддержка и сопровождение — Консультации, адаптация, внедрение, обучение пользователей.
Стоимость решений и услуг, представленных на данном сайте, формируется индивидуально по запросу клиента.
Научная и техническая основа
GeneCut использует алгоритмы оптимизации кодонного состава, подбора олигонуклеотидов, расчета температур плавления, разбиения последовательностей на блоки и моделирования клонирования. Результаты расчетов могут использоваться как подготовительный этап перед лабораторными экспериментами.
Связь с командой
Если вас интересует GeneCut, внедрение сервиса в рабочий процесс лаборатории или разработка специализированного решения на его базе, напишите нам.
